Cục Thống kê tỉnh Nghệ An được tổ chức thành hệ thống dọc 2 cấp theo đơn vị hành chính, bảo đảm nguyên tắc tập trung thống nhất:
Trạm Cảnh báo bão và Thủy văn Cửa Lò - Bến Thủy
Hạt Quản lý đê Vinh